海运方面也面临无法应对突然增加的运输需求，订舱难度增大，跨境电商企业基本都需要提前订舱，甚至有些热门航线的排期从 1 周到1个月不等。尾程派送主要面临因管控导致的人手不足、交通管制等问题。由于的影响，各国都加强了检疫检验流程。为了防止蔓延，在出入境口岸对进出境货物进行严格控制，商品检疫检验环节加强，货物清关时间延长，再加上防疫消毒，增加了在途时间，使得物流时效受到影响。
关于跨境电商方面的政策，我国陆续发布了《关于实施支持跨境电子商务零售出口有关政策意见的通知》《有关跨境电子商务零售进口税收政策的通知》等政策文件，给我国跨境电商物流模式发展提供了一些有效政策依据。跨境电商物流相关政策文件基本上是关于宏观方面的指导，缺乏微观方面的政策指示，如海关与商检等环节的差异性问题。
跨境物流企业需持续跟进新的信息技术和物流技术，从而增强跨境响应能力，降低其物流成本的提高服务管理水平，以提升跨境电商的综合效益。近几年我国加速了投资建设如高速公路、高速铁路、保温库等物流基础设施，开发和引进先进的物流设备，国内部分巨型企业也在布局物流基础设施的建设，各大城市不断涌现出一些大型物流中心、园区和配送中心等。显然，我国物流基础设施已经得到了显著的发展。
另一方面，数据中心可以结合大数据和云计算等技术，预测各产品需求量，促使企业提前备货。信息传播会提高运输效率，信息传输到供应商、制造商和分销商处，他们可以根据信息和产品运输时间，提前联系物流公司，提高货物运输效率，降低运输时间，提高商品流通效率。
